乌兹别克斯坦和阿塞拜疆人民因相似的民族习俗和传统、共同的语言、文化和宗教而团结在一起,两国都是突厥语族。多年来这两个国家都是苏联的加盟共和国，新独立国家之间于1995年10月2日建立外交关系，1996年8月阿塞拜疆共和国驻乌兹别克斯坦大使馆开始工作，1998年7月乌兹别克斯坦共和国驻阿塞拜疆共和国大使馆成立。各国在联合国、伊斯兰会议组织、独联体等国际组织框架内建立了合作。两国都是突厥国家组织的成员。

乌兹别克斯坦一贯支持通过政治手段和平解决卡拉巴赫冲突，认为确保阿塞拜疆领土完整是解决冲突的主要条件之一。自1997年以来阿塞拜疆议会设立了阿塞拜疆和乌兹别克斯坦议会间关系双边工作组。

1996年5月26日至27日，乌兹别克斯坦共和国总统伊斯兰·卡里莫夫对阿塞拜疆进行首次正式访问。访问期间两国签署了由19项协议组成的一揽子特别文件，其中就有《两国友好合作协定》,访问期间乌兹别克斯坦总统卡里莫夫被授予巴库国立大学名誉博士称号。

1997年6月18日至19日，阿塞拜疆共和国总统盖达尔·阿利耶夫对乌兹别克斯坦进行正式访问。与巴库一样在塔什干签署了 19 份文件，其中阿塞拜疆与乌兹别克斯坦关于进一步发展合作、加强友谊和伙伴关系的协议具有重要意义。阿塞拜疆总统盖达尔·阿利耶夫在签字仪式上发表讲话时表示：“我们希望在阿塞拜疆与乌兹别克斯坦建立可靠的伙伴关系，我们将尽一切努力确保这些关系的存在、发展和加强。” 乌兹别克斯坦总统表示，两国关系将具有战略性。1997年6月19日塔什干大学授予阿塞拜疆总统荣誉博士学位。1998年8月9日，阿塞拜疆总统盖达尔·阿利耶夫在雅尔塔举行的乌克兰总统库奇马就任60周年纪念活动上再次会见乌兹别克斯坦总统。会议讨论了共同关心的问题。2004年3月23日至24日，阿塞拜疆共和国下一任总统伊利哈姆·阿利耶夫对乌兹别克斯坦共和国进行国事访问。双方就阿塞拜疆和乌兹别克斯坦双边关系前景、南高加索和中亚安全问题以及地区和国际问题交换了意见。2019年10月14-15日乌兹别克斯坦总统米尔济约耶夫对阿塞拜疆进行正式访问，出席突厥国家组织突厥理事会第七次峰会。两国签署了133份文件，包括：《友好合作条约》（1996年）、《阿塞拜疆植物保护和经济作物研究所与阿塞拜疆育种、种子生长和农业技术研究所科学技术合作协定》乌兹别克斯坦共和国棉花种植情况（2021 年）。

自1997年6月18日起，乌兹别克斯坦和阿塞拜疆政府间经济合作委员会开始运作。截至2023年7月1日有204家阿塞拜疆参股企业在乌兹别克斯坦运营，其中67家为合资企业，137家100%外资参股企业以及一家生产丝绸“Sheki Ipek”的合资企业。计划在巴尔达开设一家丝绸生产合资企业，乌兹别克斯坦向阿塞拜疆提供棉花加工厂设备， Azermash OJSC 使用乌兹别克斯坦提供的零部件组装雪佛兰汽车。农业、蚕桑、纺织、化工等领域有互动。另外就是乌兹别克-阿塞拜疆投资基金，2010年乌兹别克斯坦和阿塞拜疆之间的贸易额达2590万美元，2023年1月至2023年5月，乌兹别克斯坦设立了22家合资企业。

乌兹别克斯坦和阿塞拜疆之间的文化联系每年都变得越来越紧密。阿利舍尔·纳沃伊 (Alisher Navoi) 纪念碑在巴库竖立，尼扎米·甘贾维 (Nizami Ganjavi) 纪念碑在塔什干竖立。塔什干国立师范大学以尼扎米·甘贾维的名字命名，自2002年以来阿塞拜疆-乌兹别克斯坦友好协会一直在这所大学的基础上运作，阿塞拜疆文化中心由此得名。G. Aliyev于2010 年落成，在阿塞拜疆有一个纪念纳沃伊的定居点。

乌兹别克斯坦共和国总统沙夫卡特·米尔济约耶夫在 2023 年选举后首次访问阿塞拜疆这体现了两国合作的最高水平，体现了双方和解的愿望，也体现了在国际关系新现实和新丝绸之路建设中存在充足的互动机遇，谈判完成后阿塞拜疆和乌兹别克斯坦签署了以下文件：

— 关于建立阿塞拜疆共和国和乌兹别克斯坦共和国国家间最高委员会的协定；

— 阿塞拜疆共和国经济部国家反垄断政策和消费者市场监督局与乌兹别克斯坦共和国竞争发展和保护消费者权利委员会之间的合作议定书；

— 关于在实施许可证表格电子交换信息系统领域开展合作的议定书；

—文化领域合作议定书；

—关于深化能源领域合作的协议；

— 阿塞拜疆共和国安全理事会秘书处与乌兹别克斯坦共和国总统领导的安全理事会办公室之间的合作备忘录；

— 关于阿塞拜疆共和国和乌兹别克斯坦共和国公民免签证旅行协定的修正和补充议定书；

—青年政策和体育领域合作协定；

—阿塞拜疆共和国和乌兹别克斯坦共和国之间发展媒体领域合作的“路线图”；

—《2023-2024年深化阿塞拜疆共和国和乌兹别克斯坦共和国全面战略伙伴关系路线图》

会议期间乌兹别克斯坦和阿塞拜疆领导人讨论了贸易发展、产业合作、区域合作、物流问题等。沙夫卡特·米尔济约耶夫强调各国签署的关于成立最高国家间委员会的协议开启了与阿塞拜疆双边关系的新阶段。

乌兹别克斯坦向西的所有物流路线均规划经过阿塞拜疆，塔什干正在积极解决困难的地理形势问题，扩大通过土库曼斯坦的运输路线，进入里海并进一步通往阿塞拜疆、土耳其和欧洲。这就是跨里海路线在巴库被称为“中间路线”。近年来沿线运输的货物量不断增加，从这个意义上说方向起着关键作用。

2022年通过巴库港的乌兹别克斯坦货物运输量增加了近2倍，乌兹别克斯坦打算利用阿塞拜疆的现代运输网络进一步增加货物运输，在此背景下沙夫卡特·米尔济约耶夫和伊利哈姆·阿利耶夫的会晤讨论了在跨里海走廊内建立联合物流公司，以及在巴库和第三国港口建设仓库基础设施和物流中心的问题。

新航线穿越亚美尼亚领土，鉴于巴库和埃里温之间存在分歧，与亚美尼亚协调路线的问题尚未解决。乌兹别克斯坦与其他中亚国家一道有兴趣开通经过亚美尼亚的所谓“赞格祖尔走廊”，并准备支持阿塞拜疆实施该项目。“赞格祖尔走廊”是阿塞拜疆与其纳希切万自治区之间的交通枢纽。接下来是土耳其的领土。

8月22日谈判期间沙夫卡特·米尔济约耶夫在 2021 年 3 月 31 日举行的突厥理事会非正式峰会上指出，乌兹别克斯坦愿意为修复卡拉巴赫的纪念碑、文化和教育物品做出贡献。 2023年8月22日乌兹别克斯坦总统沙夫卡特·米尔济约耶娃（Shavkat Mirziyoyeva）和他的妻子齐罗阿通·米尔济约耶娃（Ziroathon Mirziyoyeva）以及阿塞拜疆总统伊利哈姆·阿利耶夫（Ilham Aliyev）和他的妻子梅赫里班·阿利耶娃（Mehriban Aliyeva）参加了以米尔佐·乌鲁格别克（Mirzo Ulugbek）命名的第一中学的开学典礼。在富祖里学校校长哈贾尔·马赫穆多瓦向乌兹别克斯坦总统沙夫卡特·米尔济约耶夫表示感谢，并通过他向乌兹别克斯坦人民表示感谢，感谢他们建造和捐赠了这所精彩的学校。 学校设计容纳 960 名学生，建设工作于去年开始， 该建筑占地3公顷，由两层楼和一个地下室组成，学校有40间教室、6个实验室、2个计算机班、5个功能教室、一个500个座位的礼堂、一个健身房、一个320个座位的食堂、一个图书馆。 校园内有足球场、娱乐和活动场所、跑道、会议室、检查站、锅炉房、水箱和变电站，阿塞拜疆总统伊利哈姆·阿利耶夫表示：“这是外国国家在卡拉巴赫恢复过程中收到的第一份礼物，我们非常赞赏这种兄弟情谊、团结和支持的姿态。 更不用说这所学校实际上是一座教育殿堂。 今年5月我在访问富祖利时熟悉了这座建筑，亲眼目睹了乌兹别克斯坦为我们提供的兄弟礼物的规模。 这所学校以乌兹别克人民伟大儿子米尔佐·乌鲁别克的名字命名，我相信它不仅会成为教育中心而且会成为我们友谊和兄弟情谊的另一个中心。”

新学校将进一步拉近我们两国人民的距离，向年轻的阿塞拜疆人介绍乌兹别克斯坦丰富的历史和文化，这是我们伟大祖先的遗产。两国领导人携夫人为学校剪彩并揭牌，总统们参观了教学楼和校园，与学生们亲切交谈祝愿他们学业有成。

随后各国元首参观了富祖利市正在建设的住宅小区。总统们会见了该地区的居民，他们获得了新公寓的钥匙并祝贺他们乔迁之喜。真诚的交谈讲述了乌兹别克斯坦和阿塞拜疆两国人民之间深厚的友谊和兄弟般的关系。

乌兹别克斯坦共和国总统沙夫卡特·米尔济约耶夫满意地注意到富祖利的生活已恢复正常，并高度赞赏阿塞拜疆总统伊利哈姆·阿利耶夫为恢复和发展卡拉巴赫并确保最舒适的生活而开展的创造性工作人口的条件。沙夫卡特·米尔济约耶夫向阿塞拜疆人民表达了和平、安宁与繁荣的祝愿， 两国元首参观了新公寓然后登上观景台，视察破坏后果和施工进度。乌兹别克斯坦总统获悉恢复菲祖利的计划。

2023年9月19日阿塞拜疆通过启动“反恐措施”继续捍卫其在纳戈尔诺-卡拉巴赫的国家利益。阿塞拜疆国防部指责亚美尼亚军队加强卡拉巴赫的战斗阵地，并对阿塞拜疆军队的阵地进行系统炮击。巴库表示其军事人员将摧毁亚美尼亚阵地和军事设施。9月20日上午阿塞拜疆宣布继续敌对行动并扣押亚美尼亚军事装备。结果纳戈尔诺-卡拉巴赫冲突各方就完全停止敌对行动达成了协议。未被承认的阿尔扎赫共和国当局对此进行了报道，该协议自2023年9月20日13时起生效，该协议随后得到了阿塞拜疆国防部的确认， 该协议是通过俄罗斯维和特遣队指挥部的调解达成的，内容包括：

- 将亚美尼亚共和国武装部队的剩余部队和军事人员撤出俄罗斯维持和平特遣队的部署区；

- 纳戈尔诺-卡拉巴赫国防军解散并完全解除武装；

- 从纳戈尔诺-卡拉巴赫领土撤出重型装备和武器“以便迅速处置”；

- 根据达成的协议“关于重返社会、确保纳戈尔诺-卡拉巴赫亚美尼亚人的权利和安全的问题以及在阿塞拜疆宪法框架内确保纳戈尔诺-卡拉巴赫人民生计的问题将当地亚美尼亚民众代表与阿塞拜疆共和国中央当局代表将于 2023 年 9 月 21 日在耶夫拉赫市举行会议以及随后的会议上讨论这些问题。

乌兹别克斯坦共和国密切关注纳戈尔诺-卡拉巴赫的事态发展，支持兄弟的阿塞拜疆人民保护国家利益，同时确保国家领土完整。